水利部印發《關于推動河長制從“有名”到“有實”的實施意見》（以下簡稱《實施意見》），提出要聚焦管好“盆”和“水”，集中開展“清四亂”行動，系統治理河湖新老水問題，向河湖管理頑疾宣戰，推動河長制盡快從“有名”向“有實”轉變，從全面建立到全面見效，實現名實相副。
2016年11月全面推行河長制以來，截至2018年6月底，全國31個省（自治區、直轄市）全面建立河長制，河長制的組織體系、制度體系、責任體系初步形成，每條河流都有了河長，實現了河長“有名”，全面推行河長制進入新階段。
《實施意見》提出，要管好盛水的“盆”，集中開展全國河湖“清四亂”專項行動。明確了清理“四亂”（亂占、亂采、亂堆、亂建）的范圍和標準，指出“清四亂”是對各級河長的底線要求，各地要按照水利部統一安排，到2019年7月底前完成專項行動任務，堅決清除存量。在此基礎上，再用半年左右時間進行“回頭看”，力爭2019年底前還河湖一個干凈、整潔的空間。
《實施意見》提出，要護好“盆”中的水，明確防范“水多”、防治“水少”、整治“水臟”、減少“水渾”的具體要求，全面清理影響行洪安全和水生態、水環境的各類經濟活動，從根子上解決當地突出水問題。
《實施意見》提出，要加強統籌協調，流域管理機構要充分發揮協調、指導、監督、監測作用，加強流域內溝通協調；各區域間河流下游要主動對接上游，左岸要主動對接右岸，湖泊占有水域面積大的要主動對接水域面積小的，積極銜接跨行政區域河湖管理保護目標任務；部門間要細化分工，細化責任，細化工作標準，制定可量化、可考核的工作目標要求，既分工合作，各司其職，又密切配合，形成合力。
《實施意見》提出，要夯實工作基礎，依法劃定河湖管理范圍，明確管理界線、管理單位和管理要求；建立“一河一檔”，完善河湖基礎信息；編制“一河一策”，明確河湖治理保護的路線圖和時間表；抓好規劃編制，讓規劃管控要求成為河湖管理保護的“紅綠燈”“高壓線”；推廣應用大數據等技術手段，為各級河長決策和河湖的精細化管理提供技術支撐。
《實施意見》提出，要建立責任機制、督察機制、公眾參與機制，落實河長制各項保障措施。水利部將建立全覆蓋的河長制督察體系，以務實管用高效為目標，明查暗訪相結合、以暗訪為主，及時準確掌握各級河長履職和河湖管理保護的真實情況。同時，水利部設立河長制監督電子信箱hzjd@mwr.gov.cn，接受社會公眾監督舉報。
